Кафедра минералогии была основана на геологическом факультете в 1870 г. В разные годы кафедрой заведовали М.А.Толстопятов, В.И.Вернадский, Н.А.Смольянинов, Г.П.Барсанов. В настоящее время ею руководит чл.-корр. РАН профессор А.С.Марфунин. Штатный состав кафедры в 2000 году - 37 человек.