Современная кафедра палеонтологии была основана в 1939 году академиком А. А. Борисяком и Ю. А. Орловым, хотя история палеонтологических исследований и палеонтологического образования в Московском университете берет свое начало с 1805 года с деятельности профессора Г. И. Фишера фон Вальдгейма. В настоящее время кафедра палеонтологии в МГУ- ведущий центр палеонтологического и биостратиграфического высшего образования в России. Студенты получают фундаментальную подготовку по трем циклам учебных дисциплин: биологическим, геологическим, и палеонтологическим собственно. Выпускники кафедры получают квалификацию геолог со специализацией палеонтология и биостратиграфия. С 1939 года кафедра выпустила специалистов. Более половины из них работали и работают в области палеонтологии в академических, ппроизводственных геологических организациях, часть в биологических и геологических учреждениях, не связанных непосредственно с палеонтологией, часть сменила свою специальность. С момента основания кафедра имеет тесные связи с Палеонтологическим институтом

Российской академии наук. Основатели кафедры были в то же врмя директорами Палеонтологического института. Нынешний директор А. Ю. Розанов - один из ведущих профессоров кафедры.

Крупнейшие ученые академии читают лекции студентам. Это позволяет получать студентам и аспирантам знания на самом современном научном уровне и из первых рук. С 1988 года связи кафедры и Палеонтологического института официально оформлены в виде образования в институте филиала кафедры. Часть учебных курсов студенты кафедры проходят непосредственно в лабораториях института и в Палеонтологическом музее им. академика Ю. А Орлова. Студенты и аспиранты пользуются приборами и оборудованием институтских лабораторий и музея, проводят совместные научные исследования с сотрудниками института, участвуют в экспедициях. Штаты кафедры состоят из преподавателей, научных и научно-технических сотрудников